Agris category codes: U10
COBISS
1.01 Jezik: angleški
Enostavna reparametrizacija za
izboljšanje konvergence linearnih mešanih modelov
1,
Tina FLISAR, Jose Carlos MARTÍNEZ-ÁVILA, Luis Alberto
GARCÍA-CORTÉS
1 Univ. v Ljubljani,
Biotehniška fak., Odd. za zootehniko, Groblje 3, SI-1230 Domžale, Slovenija,
dr.
IZVLEČEK
Počasna konvergenca je eden največjih problemov uporabe
metode Monte Carlo z Markovimi verigami (McMC) za mešane modele na področju
genetike in selekcije domačih živali. Slaba konvergenca je v veliki meri
posledica visoke posteriorne korelacije med komponentami variance in
rešitvami za ravni pripadajočih vplivov. Predstavljamo enostavno
reparametrizacijo običajnega modela, ki izboljša lastnosti metode McMC in
daje enake posteriorne porazdelitve parametrov modela kot standardni
pristop. Reparametrizacija temelji na standardizaciji hierarhičnih
(naključnih) vplivov v modelu, kar posledično spremeni posteriorne
korelacije med parametri. Oba pristopa smo primerjali na večjem setu
simuliranih podatkov. Rezultati kažejo, da reparametrizacija vodi do bolj
učinkovitih metod McMC vzorčenja in je nekajkrat bolj učinkovita za analizo
lastnosti z nizko heritabiliteto.
Agris category codes: L01
COBISS
1.01 Jezik: angleški
Multivariatna analiza fenotipskih
razlik med “Bunaji” in “Sokoto Gudali” govedom
1,
Kingsley Omogiade IDAHOR, Hadiza Salihu HARUNA, Matthew
WHETO, Samuel AMUSAN
1 Nasarawa State Univ., Fac. of Agriculture, Dept. of Animal
Science, Keffi, Shabu-Lafia Campus, P.M.B. 135, Lafia, Nigeria
IZVLEČEK
V študiji smo z multivariatno diskriminantno analizo
proučevali morfometrične razlike med dvema nigerijskima pasmama goveda.
Merili smo deset morfoloških lastnosti (višina vihra, višina trupa, obseg
prsi, dolžina telesa, dolžina glave, dolžina repa, dolžina trupa, širina
glave, širina trupa in širina pleč) pri 224 živalih pasme “Bunaji” in 87
živalih pasme “Sokoto Gudali”. Živali so bile v ekstenzivni reji, stare med
2,5 ter 3,6 leti. Izmerjene vrednosti za linearne lastnosti živali pasme
“Sokoto Gudali” so bile statistično značilno večje (P<0,05) kot pri
živalih pasme “Bunaji”, izjema sta bila le dolžina telesa in dolžina glave.
Za doseganje boljše resolucije smo uporabili postopno diskriminantno
analizo, ker so le tri spremenljivke, širina telesa, višina vihra in dolžina
glave, omogočile zanesljivo ločevanje obeh pasem. Mahalanobijeva distanca
(7,19) med obema pasmama je bila visoko statistično značilna, kar nakazuje,
da populaciji pripadata različnim pasemskim skupinam. Te rezultate potrjuje
tudi diskriminantna analiza najbližjih sosedov, kjer je bilo 85,48% “Bunaji”
goveda razvrščenega v izvorno populacijo, medtem, ko je bil ta odstotek pri
“Sokoto Gudali” pasmi še višji (96,55). Tako pridobljene fenotipske
informacije bomo uporabili za še natančnejši opis , zaščito in oblikovanje
rejske strategije obeh nigerijskih pasem goveda.
Agris
category codes: P30, P34 COBISS
1.01 Jezik: angleški
Na antibiotike odporne bakterije v
visokogorskih tleh Himalaje (5000–6000 m)
1
1Univ. v Ljubljani,
Biotehniška fak., Odd. za zootehniko, Groblje 3, SI-1230 Domžale, Slovenija,
dr.
IZVLEČEK
V študiji sem uporabil vzorce tal z nizko vsebnostjo
organskega ogljika iz višinskega transekta 5000 m–6000 m kot poenostavljen
modelni sistem z nizko kompleksnostjo interakcij. Ta bi lahko pomagal
razumeti osnovne okoljske dejavnike, ki uravnavajo porazdelitev in obseg
izraženih rezistenčnih lastnosti gojljivega dela hitro rastočih
heterotrofnih sevov. Izboljšano štetje na ploščah sem izvedel pri 4°C na
0,01 koncentriranem hranilnem bujonu, dopolnjenim s hladnim ekstraktom tal,
kot splošnim gojiščem, ki sem ga dopolnil z posameznimi antibiotiki (ampicilin,
eritromicin, kanamicin in tetraciklin). Večje število izolatov (500) iz
šestih lokacij sem prav tako testiral ločeno na njihovo odpornost na
antibiotike. Ugotavljal sem tudi povezavo med okoljskimi dejavniki ter
porazdelitvijo odpornih sevov in splošnega gojljivega deleža talnih
bakterij. Rezultati kažejo, da visokogorska hladna tla vsebujejo pri nizkih
temperaturah gojljive bakterijske populacije (106 / g), ki so odporni na
posamezne antibiotike in razne njihove kombinacije, uporabljene v tej
študiji. Poraščena tla imajo največji delež odpornih bakterij, skoraj dva
reda manjši pa je prisoten v golih tleh. Statistična analiza je pokazala, da
vegetacija, organski ogljik ter pH uspešno razložijo interakcijo med
okoljskimi dejavniki in posameznimi gojenimi deleži bakterij, izoliranih iz
hladnih tal.
Agris
category codes: P10, T01
COBISS
1.01 Jezik: angleški
Metil živo srebro inhibira rast in povzroča spremembe v membranah bakterije
Pseudomonas putida
1, Mirjana BISTAN, Maša ZOREC,
Romana MARINŠEK LOGAR
1Univ. v Ljubljani,
Biotehniška fak., Odd. za zootehniko, Groblje 3, SI-1230 Domžale, Slovenija
IZVLEČEK
V raziskavi smo na bakterijskem modelu (Pseudomonas
putida DSM 50026) analizirali strupenost okoljskih koncentracij anorganske (Hg(II))
in organske (MeHg) oblike živega srebra, ki predstavljata pomembna vira
onesnaženja vodnih ekosistemov v bližini nekaterih industrijskih in
rudarskih območij. Poleg neposrednega spremljanja bakterijske rasti smo
analizirali tudi maščobnokislinske profile izpostavljenih bakterijskih
kultur in jih primerjali s tistimi, ki živosrebrovima spojinama niso bili
izpostavljeni. Rezultati so pokazali, da izpostavitev P. putida Hg(II) v
koncentracijah med 0,2 in 200 µg/L ne inhibira rasti, niti ne vpliva na
maščobnokislinsko sestavo bakterijskih membran. Nasprotno pa je izpostavitev
celic do 1600-krat nižjim koncentracijam MeHg povzročila tako upočasnitev
rasti kot tudi prilagoditvene spremembe na membranskem nivoju. Slednje so
bile podobne kot tiste, opažene ob izpostavitvi bakterij organskim topilom
in nekaterim drugim spojinam, ki motijo integriteto membran.
Agris category codes: Q04
COBISS
1.01 Jezik: angleški
Maščobnokislinski profil in prehranska vrednost jadranske sardele (Sardina
pilchardusWalb.)
v odvisnosti od sezone ulova [1]
Monika MARIN 1, Tomaž POLAK, Lea GAŠPERLIN,
1 Droga
Kolinska, Živilska industrija, d.d., Kolinska 1, SI-1000 Ljubljana, Slovenija
IZVLEČEK
Raziskovali smo kemijsko (vsebnost vode, beljakovin,
maščob in mineralnih snovi) in še posebej maščobno kislinsko sestavo mesa
sardel ter določili njeno prehransko vrednost. Jadranske sardele (Sardina pilchardus Walb.) so bile ujete v severnem Jadranskem morju v štirih
različnih lovnih sezonah: pozimi, spomladi, poleti in jeseni. Z metodo in
situ transesterifikacije in določitve na plinsko tekočinskem kromatografu
smo določili 20 maščobnih kislin. Meso sardin povprečno vsebuje 70,8 % vode,
21,0 % beljakovin, 2,5 % mineralnih snovi in 6,4% maščob; od skupnih
maščobnih kislin je 18,0 % enkrat nenasičenih, 42,6 % večkrat nenasičenih
ter 39,8 % nasičenih. Vsebnost maščob je močno nihala med sezonami
(naraščala od zime proti jeseni, od 0,69 % do 18,15 %) in statistično
značilno vplivala na maščobnokislinsko sestavo mesa. Največ večkrat
nenasičenih maščobnih kislin (skupaj 4,6 g/100 g mesa), predvsem
eikozapentaenojske (20:5n-3, 0,98 g/100 g mesa) in dokozaheksaenojske
(22:6n-3, 1,9 g/100 g mesa) so vsebovale sardele jesenskega ulova (pred
drstenjem). Razmerja n-6/n-3 (0,13) in P/S (7,6) kažeta, da imajo sardine
visoko prehransko vrednost. Priporočen dnevni vnos večkrat nenasičenih
maščobnih kislin (0,45 g/dan za zdravo populacijo) dosežemo že z dnevnim
zaužitjem 100 g mesa sardel, ujetih pozimi, in 10 g mesa sardel, ujetih
jeseni.
Ključne besede: prehrana ljudi / živila / ribe /
jadranska sardela / Sardina pilchardus Walb. / sestava / maščobne kisline /
prehranska vrednost / letni čas
[1]Prispevek je del magistrskega dela
Monike Marin z naslovom ‘Vpliv sezone ulova na lipidno sestavo in
senzorično kakovost jadranske sardele (Sardina pilchardus)’,
mentor prof. dr. Božidar Žlender.
Agris category codes: L01
COBISS
1.01 Jezik: angleški
Obnašanje ovc
na kraškem pašniku z različno vegetacijo [1]
1,
Danijela BOJKOVSKI, Ivan ŠTUHEC, Dragomir KOMPAN
1 Univ.
v Ljubljani, Biotehniška fak., Odd. za zootehniko, Groblje 3, SI-1230
Domžale, Slovenija, doc. dr., mag.
IZVLEČEK
Poskus je bil zastavljen z namenom proučiti obnašanje ovc
na pašniku s čredinkami, v katerih so obstajale tri različne vrste
vegetacije: travna ruša (n = 3), gozdna (n = 2) in delno zaraščena z drevesi
in grmovjem (n = 1). Trop 40 ovc se je pasel na kmetiji na kraškem svetu v
Sloveniji. Deset individualnih ovc je bilo direktno opazovanih v času dnevne
osvetlitve (od 5. do 21. ure). Ovce so bile opazovane 2 zaporedna dneva v
posamezni čredinki z eno ponovitvijo, torej skupaj 12 dni. Opazovana je bila
dolžina zauživanja zelinja (+ listje iz grmovja in dreves), dnevni ritem
zauživanja travne ruša, pogostost pitja in zauživanja soli. Na dan so se
ovce pasle povprečno 10,5 ur (povprečje ± SD = 626,2 ± 47,2 min), vendar so
bile značilne razlike med ovcami (P
<0,001). Najdaljši čas za pašo so ovce imele v čredinkah s
travno rušo (P<0,001). Podoben čas paše je bil opazovan v gozdnih čredinkah
in pol odprti čredinki. Pogostost pitja in zauživanja soli je bila nizka.
Živali so pile malo manj kot enkrat na dan, medtem ko so zaužile sol 1,25
krat na dan. Pogostost pitja je bila največja v pol odprti čredinki, kjer so
bila prisotna tudi drevesa in grmovje, medtem ko je bila največja pogostost
zauživanja soli v gozdnih čredinkah.
Ključne besede: ovce / obnašanje živali / etologija /
paša / pašniki / čredinke / vegetacija / Kras / pitje / zauživanje soli /
Slovenija
[1]Prispevek je del diplomske naloge
Danijele Tomažič, mentor prof. dr. Ivan Štuhec, somentor prof. dr.
Dragomir Kompan.
Agris category codes: M40
COBISS
1.01 Jezik: angleški
Fluktuacijska
asimetrija pri diploidnih in sterilnih triploidnih samicah kalifornijske
postrvi (Oncorhynchus
mykiss)
1,
Klavdija STRGAR
1 Univ.
v Ljubljani, Biotehniška fak., Odd. za zootehniko, Groblje 3, SI-1230
Domžale, Slovenija, prof., dr.
IZVLEČEK
Vitalnost nekega organizma in verjetnost, da preživi v
naravi, je mogoče presojati na podlagi velikosti fluktuacijske asimetrije (FA).
Ta je določena s tem, koliko telo določenega osebka odstopa od popolne
simetrije. Da bi ocenili ali se samice in sterilni triploidni osebki
kalifornijske postrvi (Oncorhynchus mykiss) med seboj razlikujejo v FA, smo
pri 150 osebkih iz obeh populacij določili število plavutnic v prsnih in
trebušnih plavutih na obeh straneh telesa. Kot mero za asimetrijo smo
uporabili absolutno razliko v številu plavutnic v prsnih in trebušnih
plavutih, na vsaki strani telesa. Rezultati kažejo, da je za obe lastnosti
FA večja pri diploidnih osebkih; razlika med populacijama je dovolj velika,
da jo lahko štejemo kot statistično značilno le, če obe lastnosti
obravnavamo združeno. Delo problematizira možnost presojanja sposobnosti
preživetja le na osnovi FA in poudarja, da bi bilo nujno za določanje FA
uporabiti metrične lastnosti.
Agris category codes: L10
COBISS
1.01 Jezik: slovenski
Ocena
parametrov disperzije za lastnosti zunanjosti pri konjih haflinške pasme
1,
Janez RUS, Milena KOVAČ, Špela MALOVRH
1 Univ.
v Ljubljani, Biotehniška fak., Odd. za zootehniko, Groblje 3, SI-1230
Domžale, Slovenija, asist.
IZVLEČEK
V naši raziskavi smo pri konjih haflinške pasme v
Sloveniji za lastnosti zunanjosti ocenjevali komponente (ko)varianc. V
podatkovni zbirki je bilo skupaj 3371 živali, od tega smo jih v raziskavo
vključili 600 (15 žrebcev in 585 kobil). Živali, ki smo jih vključili v
analizo, so imele zapise desetih ocen in/ali devetih meritev ter znanega
vsaj enega od staršev. Model je za vse ocenjene in izmerjene lastnosti
vseboval leto ocenjevanja in/ali merjenja kot sistematski vpliv in naključni
vpliv živali. Uporabili smo metodo omejene največje zanesljivosti (REML) v
programu VCE. Pozitivno definitne matrike smo dobili s pomočjo postopka, ki
se imenuje ukrivljanje matrik (ang. bending). Za ocenjene lastnosti so
znašale heritabilitete od 0,40 za prednji del trupa do 0,78 za pasemsko
značilnost. Heritabilitete za izmerjene lastnosti so se gibale med 0,20 za
globino prsi in 0,62 za višino vihra, merjeno s palico. Genetske korelacije
so bile v večini pozitivne. Najvišja genetska korelacija pri ocenjenih
lastnostih je 0,92 med skupno oceno in zadnjim delom trupa. Med oceno
pasemske značilnosti in oceno prednjih nog korelacije ni bilo. Pri
izmerjenih lastnostih so bile genetske korelacije ocenjene od 0,38 med
dolžino trupa in obsegom prsi do 0,95 med višino vihra, merjeno s palico in
višino vihra, merjeno s trakom.
Ključne besede: konji / pasme / haflinška pasma /
haflinger / lastnosti zunanjosti / selekcija / genetski parametri /
Slovenija